Vés al contingut

Estudis

ABACO, un servidor de càlcul per a la realització de càlculs complexos i simulacions

14 desembre 2017

El nou servidor és una eina molt útil que permet obtenir informació detallada d’una gran varietat de sistemes i facilita l’enteniment i l’optimització de l’observació experimental.

ABACO

Un superdordinador és un ordinador d’alt rendiment format per un conjunt de processadors interconnectats entre si per tal d’augmentar la seva potència de treball i el seu rendiment. Els superodinadors permeten realitzar càlculs intensius i a gran velocitat, els quals serien impossibles de ser executats en els ordinadors comuns portàtils o d’escriptori.

ABACO és el nom amb què ha estat batejat el servei de supercomputació d’IQS, inaugurat el passat mes de Juny de 2017. El servidor de càlcul està basat en una tecnologia híbrida que combina la potència de càlcul dels processadors més avançats (CPU) amb unitats de processament gràfic d'última generació (GPU) que permeten accelerar les simulacions a quotes inaccessibles fa pocs anys. Segons paraules del Dr. Fèlix Llovell, amb ABACO es poden realitzar càlculs computacionals complexos mitjançant l’ús de diferents programes instal·lats, i que s’utilitzen segons les necessitats i el tipus de càlcul. Es tracta d’una eina extremadament útil per obtenir informació detallada d’una gran varietat de sistemes, aportant un valor afegit que facilita l’enteniment de l’observació experimental i permet la seva optimització.

Les possibilitats i aplicacions d’aquest ordinador d’alt rendiment són molt diverses. En podem destacar:

  • Dinàmica computacional de fluids (CFD) per estudis fluidodinàmics. Aplicacions en àrees tan diverses com la biomedicina, la química i l’aeronàutica, entre d’altres.
  • Simulació de sistemes moleculars per obtenir informació química i estructural del seu mecanisme d’interacció amb compostos de naturalesa variada: adsorbents, surfactants, receptors d’interès biològic, etc. Molt útil en àrees de química orgànica, química ambiental, disseny de fàrmacs i química mèdica.
  • Simulació atomística i quàntica. Aplicacions en estudis estructurals i de la dinàmica i reactivitat de proteïnes i altres macromolècules.
  • Disseny d’anticossos i de biocatalitzadors assistit per ordinador mitjançant el càlcul d’estructures i propietats macromoleculars amb aplicacions en biotecnologia industrial.
  • Anàlisi massiu de seqüències genòmiques i proteòmiques amb aplicacions en biomedicina per a la identificació de noves variants genètiques involucrades en malalties congènites.
  • Tractament de dades (Big Data Analysis) i altres àrees de Màrqueting.

Actualment, s’està utilitzant aquesta eina en projectes de diferents grups de recerca a IQS per donar resposta a problemes tan variats com la simulació computacional d’artèries danyades, la determinació de les propietats de nous fàrmacs o la simulació del comportament termodinàmic en reservoris de petroli.