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Estudios

ABACO, un servidor de cálculo para la realización de cálculos complejos y simulaciones

14 diciembre 2017

El nuevo servidor es una herramienta muy útil que permite obtener información detallada de una gran variedad de sistemas, y facilita el entendimiento y la optimización de la observación experimental.

ABACO

Un superordenador es un ordenador de alto rendimiento formado por un conjunto de procesadores interconectados entre sí, con el fin de aumentar su potencia de trabajo y su rendimiento. Los superordenadores permiten realizar cálculos intensivos y a gran velocidad, los cuales serían imposibles de ser ejecutados en los ordenadores comunes portátiles o de escritorio.

ABACO es el nombre con el que ha sido bautizado el servicio de supercomputación de IQS, inaugurado el pasado mes de Junio de 2017. El servidor de cálculo está basado en una tecnología híbrida que combina la potencia de cálculo de los procesadores más avanzados (CPU) con unidades de procesados gráficos de última generación (GPU), que permiten acelerar las simulaciones a cuotas inaccesibles hace pocos años. En palabras del Dr. Fèlix Llovell, con ABACO se pueden realizar cálculos computacionales complejos mediante el uso de diferentes programas instalados, y que se utilizan según las necesidades y el tipo de cálculo. Se trata de una herramienta extremadamente útil para obtener información detallada de una gran variedad de sistemas, aportando un valor añadido que facilita el entendimiento de la observación experimental y permite su optimización.

Las posibilidades y aplicaciones de este ordenador de alto rendimiento son muy diversas. Podemos destacar:

  • Dinámica computacional de fluidos (CFD) para estudios fluidodinámicos. Aplicaciones en áreas tan diversas como la biomedicina, la química y la aeronáutica entre otras.
  • Simulación de sistemas moleculares para obtener información química y estructural de su mecanismo de interacción con compuestos de naturaleza variada: absorbentes, surfactantes, receptores de interés biológico, etc. Muy útil en áreas de química orgánica, química ambiental, diseño de fármacos y química médica.
  • Simulación atomística y cuántica. Aplicaciones en estudios estructurales y de la dinámica y reactividad de proteínas y otras macromoléculas.
  • Diseño de anticuerpos y de biocatalizadores asistido por ordenador, mediante el cálculo de estructuras y propiedades macromoleculares con aplicaciones en biotecnología industrial.
  • Análisis masivo de secuencias genómicas y proteómicas con aplicaciones en biomedicina para la identificación de nuevas variedades genéticas involucradas en enfermedades congénitas.
  • Tratamiento de datos (Big Data Analysis) y otras áreas de Marketing.

Actualmente, esta herramienta está siendo utilizada en proyectos  de diferentes grupos de investigación en IQS, para dar respuesta a problemas tan diversos como la simulación computacional de arterias dañadas, la determinación de las propiedades de nuevos fármacos o la simulación del comportamiento termodinámico en reservorios de petróleo.